水稻OsRSH基因家族的生物信息学分析

摘要：鸟苷(五)四磷酸,即(p)ppGpp(Guanosine tetraphosphate and pentaphosphate),是两类相关核苷酸ppGpp和pppGpp的总称,普遍存在于植物中。环境中光照、盐、PH、UV、植物激素等条件的变化会引起植物中(p)ppGpp水平的改变。植物中(p)ppGpp的合成和水解是由一类叫RSH(RelA/SpoT homolog)的蛋白来完成。有研究发现RSH与植物生长、基因表达及胁迫应答等密切相关,且不同植物中RSH蛋白的种类、结构和表达方式各有不同。本研究利用Interpro、Clustal Omega、splitstree、Plant CARE、Rice xpro等生物工具,分别对水稻RSH家族各成员的蛋白结构进行比较,对它们在光照应答、组织特性表达和激素应答过程中存在的特异性和差异性进行系统的分析,对它们在植物体内的生物功能进行了初步的解析和预测。我们发现水稻Os RSH和拟南芥AtRSH在结构、功能和表达上具有高度相似性,在组织呈现特异性表达,参与激素应答过程,为今后深入开展水稻RSH基因家族的功能研究提供了一定的依据。