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北京鸭BNIP3L基因CDS区克隆及序列分析

甘伟; 任小春; 任小松 四川省达州市农业科学研究院; 四川达州635000
  • 北京鸭
  • bnip3l
  • 基因克隆
  • 序列分析

摘要:BNIP3L定位于线粒体,广泛分布于各个组织中,具有促凋亡的作用。根据NCBI上鸭BNIP3L基因预测序列设计引物,利用PCR技术,对鸭BNIP3L基因CDS区序列进行克隆。结果表明:扩增出BNIP3L基因的CDS区序列全长为543bp,编码180个氨基酸,相对分子质量为19.52ku,理论等电点为6.334。另外,该氨基酸序列存在典型的3个低密度区域和1个跨膜结构域。经比对分析发现鸭的BNIP3L基因具有特有的保守序列,而且与鸟类的BNIP3L基因具有较高的相似性,并对其氨基酸序列和蛋白质结构进行了分析,整个多肽链中疏水性氨基酸为151个,亲水性氨基酸为29个,因此整个多肽链应为疏水性。其蛋白质二级结构由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成,分别占22.78%、7.22%、17.78%和52.22%。以上数据表明北京鸭 BNIP3L基因CDS区序列与安氏蜂鸟、朱鹩、鸡具有较高的一致性,且在物种进化过程中较为保守。

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