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青南高原多房棘球蚴myophilin基因的克隆和序列分析

何顺伟; 张耀刚; 李超群; 彭源; 魏晓星 青海大学生态环境工程学院; 青海大学医学院基础医学部; 青海西宁810016
  • 多房棘球蚴
  • 亲肌肉抗原
  • 基因
  • 克隆
  • 序列

摘要:目的 克隆多房棘球绦虫(Em)的myophilin基因并对其序列进行分析与预测。方法提取Em原头节总RNA,采用RT-PCR技术扩增myophilin基因,将PCR产物连接入p GM-T载体,转化入DH 5α感受态细胞,挑选阳性克隆送测序。采用生物信息学软件对测序结果进行序列比对分析,同时预测编码蛋白的理化性质、二级结构、三级结构、翻译后修饰位点、结构域和抗原表位。结果 扩增出长度为576 bp的cDN段,包含完整开放阅读框(ORF),编码190个氨基酸,与已知细粒棘球绦虫的序列同源性达99%。预测结果显示,编码蛋白分子式为C_(935)H_(1519)N_(255)O_(285)S_(11),理论分子质量为212 876,PI为8.66。α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲在二级结构中所占的比例分别为51.58%、10.00%和38.42%。含有10个翻译后修饰位点,各1个Calponin结构域和CH结构域,8个B细胞抗原表位和6个T细胞抗原表位。结论 成功克隆出Em的myophilin基因并对其进行了有效分析和预测。

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