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基于机器学习的RNA编辑位点预测方法综述

冷嘉承; 吴凌云 中国科学院数学与系统科学研究院应用数学研究所; 管理、决策与信息系统重点实验室; 国家数学与交叉科学中心; 北京100190; 中国科学院大学数学科学学院; 北京100049
  • rna编辑
  • 高通量测序
  • 机器学习

摘要:RNA编辑是一个十分重要的生物细胞分子机制。作为转录后修饰的一步,它可以增加蛋白质组学多样性,改变转录产物的稳定性,调节基因表达等。RNA编辑失调会导致各种疾病,包括神经疾病和癌症。在动物中,腺苷到肌苷(A-to-I)的编辑是最普遍的。高通量测序技术的进步大大提高了在全局范围内检测和量化RNA编辑的能力,使得RNA编辑的大规模全基因组分析变得可行,产生了一系列基于高通量测序技术的RNA编辑位点预测方法。通过对这些方法进行介绍、总结和分析,为RNA编辑的进一步研究提供一些思路。

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