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基于高通量测序分析急性白血病患者与健康人群口腔菌群结构的变化规律以及差异性

任乐; 李大旭; 张喆; 徐纪茹 西安交通大学医学部基础医学院病原生物学与免疫学系; 西安710061; 西安交通大学第一附属医院口腔科
  • 急性白血病
  • 口腔微生物
  • 高通量测序技术
  • 物种多样性

摘要:目的分析急性白血病患者与健康人群口腔菌群结构的变化规律以及差异性。方法收集急性白血病患者60例,其中急性淋巴细胞白血病(ALL)患者10例,急性髓细胞白血病(AML)初入院患者19例、AML病情缓解患者18例、AML难治患者13例,同期纳入健康者14例作为对照组。采集患者的唾液1 ml,提取细菌总DNA,利用细菌16S rDNA基因V4区通用引物对其进行Touch Down PCR扩增,结合16S DNA V4区域扩增子测序分析技术比较患有急性白血病的人群口腔菌群分布的多样性及相似性与健康对照组相比是否存在明显差异。结果在门水平上,健康组、AML组及ALL组物种由厚壁杆菌门、变形菌门及拟杆菌门组成;AML组与健康组相比,厚壁杆菌门的丰度下降,变形菌门的丰度上升。ALL组与健康组相比,厚壁杆菌门的丰度上升,变形菌门的丰度下降。在属水平上,健康组、AML组、ALL组物种组成类似,主要均由链球菌属、奈瑟氏菌属及Prevotella-7组成,AML组与健康组相比链球菌属的丰度下降,Prevotella-7及奈瑟氏菌属的丰度上升。ALL组与健康组相比,链球菌属、Prevotella-7及奈瑟氏菌属的丰度上升。对12个样品及组间的口腔菌群差异性进行分析,结果表明,健康组、AML、ALL组口腔微生物存在一定的差异性,且AML组口腔微生物的差异性与健康组相比要高于ALL组。结论厚壁菌门在ALL组中的丰度升高,变形菌门在AML组中的丰度升高。链球菌属在ALL中的丰度升高,奈瑟氏菌属在AML组丰度升高。

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