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两种聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中的应用比较

陈载鑫; 何丹; 谢岭平; 李柳燕; 许红丽; 方佩荣; 尹沃河; 付文金 广东医科大学附属东莞市厚街医院检验科; 广东东莞523900; 武岗市人民医院; 湖南武岗422400
  • 聚合酶
  • 基因多态性
  • snp
  • 等位基因特异性引物延伸法

摘要:目的比较TaqTMHotStarDNA聚合酶和TspTMPlatinum DNA聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中的应用效果。方法取120例抗血栓治疗患者全血进行DNA提取、多重PCR扩增,将产物分2份,1份用TaqTMHotStarDNA聚合酶进行等位基因特异性引物延伸,1份用TspTMPlatinum DNA聚合酶进行等位基因特异性引物延伸,然后进行杂交反应,用Luminex 200系统检测CYP2C19基因多态性,同时将所有样本送第三方进行基因测序。结果TaqTMHotStarDNA聚合酶组检测结果与测序结果完全一致,TspTMPlatinum DNA聚合酶则会出现一些偏差,说明TaqTMHotStarDNA聚合酶参与的检测结果分辨率明显高于TspTMPlatinum DNA聚合酶参与的检测结果。结论两种聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中均可以取得一定的检测结果,但是为了结果的可靠性建议在检测过程中使用TaqTMHotStarDNA聚合酶。

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