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人参BBM基因全长cDNA的克隆及生物信息学分析

李昂; 姬文秀; 陈双越; 包悦琳; 陈鸽; 金东淳 延边大学农学院; 吉林延吉133002
  • 人参
  • bbm基因
  • 克隆
  • 序列分析

摘要:BBM(BABY BOOM)基因是属于植物AP2/EREBP基因家族的AP2亚族的转录因子,已有很多研究表明,过量表达BBM基因能够诱导植物体细胞胚,是植物体细胞胚诱导研究中应用潜力大的重要基因之一。为利用BBM基因诱导人参体细胞胚,该试验采用RACE方法克隆了2 291 bp的人参BBM基因全长cDNA,包含1 998 bp的开放阅读框(ORF),编码665个氨基酸。用其推测的编码蛋白序列与拟南芥等植物的BBM基因序列比对结果,人参BBM基因中包含euANT2-euANT6、bbm-1等基序,还包含由Linker连起来的2个AP2结构域(AP2-R1和AP2-R2),说明PgBBM是属于AP2亚族的转录因子。与其它植物已知BBM基因构建的系统发育树显示,人参BBM基因与烟草、大豆、苜蓿的BBM基因亲缘关系较近,与其它植物的BBM基因的亲缘关系较远。

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