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基于聚类分析的肺癌与基因相关关系研究

任雪菁; 安新颖; 范少萍 北京协和医学院/中国医学科学院医学信息研究所; 北京100020
  • 肺癌
  • 基因
  • 文本挖掘
  • 数据挖掘
  • 聚类分析

摘要:目的:研究与不同类型肺癌存在关联的基因及其与肺癌的关联,为肺癌相关基因领域的研究学者提供参考。方法:通过对肺癌、基因进行命名实体识别、实体数据的标准化处理、肺癌-基因矩阵构建、肺癌-基因矩阵的聚类分析、文献回溯等,基于聚类的方法发现不同类型肺癌存在关联的基因及其在肺癌不同阶段的具体关联。结果:利用聚类分析的方法将肺癌大致分为A549 lung cancer,Advanced non-small-cell lung cancer,small cell lung carcinoma四大类。高频基因主要是EGFR(在晚期非小细胞肺癌患者体内突变率较高)、P53(主要在NSCLC晩期患者中高水平突变表达)、KRAS(主要与NSCLC有关)。结论:基因、蛋白质、化学物质等实体对肺癌的产生与治疗至关重要。深入探究肺癌与基因的关系对肺癌的预防、诊断、治疗均有重要意义。

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