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新疆石河子部分地区猪流行性腹泻病毒遗传变异分析

黄新; 吴桐忠; 韩猛立; 张星星; 何延华; 钟发刚 新疆农垦科学院/省部共建新疆绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室; 新疆石河子832000
  • 猪流行性腹泻病毒
  • 遗传进化
  • s基因
  • orf3基因
  • 新疆石河子

摘要:为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)遗传变异情况,从石河子的3个地区已确诊PED猪场采集病料,分别获得了3株PEDV S基因序列和ORF3基因序列,将其进行序列比对及遗传进化分析。根据3株S基因序列分析表明,XJ-SHZ148、XJSHZ146株与韩国QIAP1401株(KX793713)序列相似性最高,达到97.4%和98.7%;XJ-SW株与广东GD-03 2012株(KP870115)序列相似性最高,达到98.5%。3个分离株与PEDV疫苗株AF353511(CV777)性序列相似性分别为94.5%、94.2%和94.1%。系统进化分析表明,XJ-SHZ148、XJ-SHZ146与韩国的KPV1406(KM108353))、QIAP1401(KX793713))同为一群。XJ-SW株与广东GD/03/2012((KP870115))、GD/2011株(KP870115)同为一群;3株PEDV ORF3基因序列与疫苗株(CV777)序列比对多个位点存在突变,序列相似性较低。

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