摘要：中国经济体制改革和社会转型伴随着科技创新体系制度基础的变革,探讨建国以来,特别是改革开放之后,中国科技创新体系制度基础变革的历程、特征及其挑战,有助于继承、发扬以往改革实践的历史经验,理解当下中国科技创新体系面临的挑战,把握未来中国科技创新体系改革的方向。本文从三个阶段分析了中国科技创新体系制度基础形成和变革的历史,总结了制度基础变革的特征与实践经验,并从防止旧体制复归、增强探索新道路的能力、全面认识市场体制的深刻内涵和塑造充满活力的创新生态体系等方面探讨了深化改革可能面临的挑战。